Политехнический университет в 2010 году получил статус национального исследовательского  университета (НИУ). Основной целью программы развития НИУ "СПБГПУ" является модернизация и развитие его как университета нового типа, интегрирующего мультидисциплинарные научные исследования и технологии в областях, определяющих конкурентоспособность национальной экономики. Организационная структура научной деятельности в ВУЗе ориентирована на достижение этой цели.

Научно-технический совет университета определяет направления научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, инновационную политику университета, осуществляет анализ результатов деятельности отдельных подразделений университета в этой сфере.

Исследовательская, инновационная и научно-производственная деятельность, подготовка научных кадров реализуются на кафедрах, в специализированных Центрах и Институтах. В их числе:

Объединенный научно-технологический институт (исполнительный директор д.т.н. А.А. Попович)

• Научно-инновационный институт материалов и технологий. Подробная информация о деятельности института представлена в буклете.
  • Отделение лазерных и сварочных технологий
  • Лаборатория «Микроскопия и микроанализ»
  • Лаборатория исследования структуры и свойств материалов
  • Лаборатория жидкофазных технологий
  • Лаборатория исследования и моделирования структуры и свойств металлических материалов
  • Лаборатория новых и перспективных материалов

• Научно-инновационный институт энергетики, ресурсосберегающих и экологических технологий

  • Центр "Техническая диагностика и надежность атомных и тепловых электрических станций”

• Научно-исследовательский институт нанобиотехнологий

  • Центр коллективного пользования "Аналитическая спектрометрия"

• Научно-исследовательский институт "Машиностроительные технологии"

• Научно-исследовательский институт "Математическое моделирование и интеллектуальные системы управления". Подробная информация о деятельности института представлена в буклете.

  • Лаборатория "Интеллектуальные системы управления"
  • Лаборатория "Вычислительная гидроакустика и турбулентность"
  • Лаборатория "Визуализация и компьютерная графика"
  • Лаборатория "Прикладная математика и механика"
  • Научно-образовательный центр "Политехник - SAP"
  • Базовый НОЦ «Моделирование и идентификация сложных механических систем»
• Научно-исследовательский институт "Электронные системы"
• НИИ ядерной физики
• Учебно-научно-производственная лаборатория "Криогенная Техника"
• Центр промышленной рентгеновской томографии
• Научно-испытательная лаборатория конструкционных материалов "ПолитехТест КСМ"
• Лаборатория «Сверхпрочные абразивные связки»
• Экспериментальное производство
• Высоковольтное энергетическое производство
• Научно-образовательные центры федеральной целевой программе "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы

Организация научных исследований, планово-экономическое сопровождение и коммерциализация их результатов обеспечивается развитой организационной структурой, в которую входят следующие подразделения.

Департамент научно-инновационной деятельности и коммерциализации (директор к.т.н. В.Э. Виколайнен) - обеспечивает взаимодействие субъектов инновационной инфраструктуры СПбГПУ, а также взаимодействие университета с реальным сектором экономики. В состав департамента входят:

• Отдел интеллектуальной собственности

• Отдел прогнозирования инновационного научно-технического развития

• Технопарк «Политехнический»

• Отдел малого инновационного бизнеса

• Отдел диагностики и экспертиз

• Бизнес-инкубатор «Политехнический»

Департамент научных исследований (директор д.э.н. А.В. Бабкин) - координирует взаимодействие подразделений университета в вопросах подготовки научных кадров, редакционно-издательской деятельности, проведения научных конференций, научного творчества молодых ученых и студентов, подготовки и подачи заявок на гранты.

Департамент научно-организационной деятельности (директор к.т.н. А.М. Митрофанов) - осуществляет информационно-аналитическую и организационную поддержку развития научной деятельности университета, в том числе – международной.

Департамент планирования, учета и финансового контроля НИОКР (директор С.М. Шелюховская) - осуществляет документационное сопровождение НИР и НИОКР, ведет оперативное планирование, финансовый и статистический учет бюджетной и внебюджетной научной деятельности структурных подразделений СПбГПУ, контролирует исполнения смет доходов и расходов по лицевым счетам договоров и научных проектов.