Базовый факультет университета является организационной структурой, объединяющей кафедры, отдельные лаборатории, центры и вспомогательные службы в единый учебный и научно-исследовательский комплекс, обеспечивающий выпуск специалистов с высшим образованием по определенной группе направлений и специальностей. Обладая известной автономностью, факультеты университета тесно интегрированы в учебном процессе, благодаря чему обучение студентов на любом факультете ведут наиболее компетентные специалисты в данной области с профильных факультетов.

Факультет возглавляется деканом, а высшим органом его управления является Совет, избираемый преподавателями и сотрудниками факультета на 3 года.

Политехнический университет, как это и было задумано при его создании, имеет в своем составе технические, физические и гуманитарно-экономические факультеты. Филиалы университета работают в 5 регионах России.

Кроме базовых факультетов, специальные образовательные программы реализуют факультеты послевузовской подготовки, профильные учебные курсы повышения квалификации различной направленности.