Физико-механический институт
- Высшая школа механики и процессов управления
- Высшая школа прикладной математики и вычислительной физики
- Высшая школа теоретической механики и математической физики
- Высшая школа фундаментальных физических исследований
- Дирекция образовательных программ
- Научная лаборатория "Диагностика высокотемпературной плазмы"
- Научная лаборатория "Теория и моделирование плазмы токамаков"
- Научная лаборатория перспективных методов исследования плазмы сферических токамаков
- Научно-исследовательская лаборатория виртуально-имитационного моделирования
- Научно-исследовательская лаборатория гидроаэродинамики
- Научно-исследовательская лаборатория математической биологии и биоинформатики
- Научно-исследовательская лаборатория управляемого термоядерного синтеза
- Научно-образовательный центр "Компьютерные технологии в аэродинамике и теплотехнике"
- Объединенная лаборатория вычислительной математики (совместно с Санкт-Петербургским отделением Математического института им. В.А. Стеклова РАН)
- Учебно-научная лаборатория по работе с талантливой молодежью